每日文摘 | 2023年03月11日

未那

Initial recommendations for performing, benchmarking and reporting single-cell proteomics experiments | Nature Methods
通过串联质谱 (MS) 分析单个细胞中的蛋白质最近在技术上变得可行。虽然此类分析有可能准确量化数千个单细胞中的数千种蛋白质，但结果的准确性和可重复性可能会受到影响实验设计、样品制备、数据采集和数据分析的众多因素的影响。在这里，作者提出了最佳实践、质量控制和数据报告建议，以帮助广泛采用可靠的单细胞蛋白质组学定量工作流程。
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The connectome of an insect brain | Science
由于技术限制，使用电子显微镜对整个大脑进行成像并从此类数据集中重建连接一直具有挑战性。到目前为止，完整的突触分辨率连接组仅被映射到具有多达数百个脑神经元的三种生物体。研究人员描述了一种基于三维电子显微镜的果蝇幼虫大脑重建方法。果蝇幼虫的大脑有更多的神经元，更多的突触和复杂的大脑组织。这种昆虫大脑连接组将成为一种持久的资源，为大量的理论和实验后续研究提供基础。
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NDEx IQuery: a multi-method network gene set analysis leveraging the Network Data Exchange | Bioinformatics
使用生物途径研究基因组是研究人员的一项常见任务，并得到各种软件工具的支持。 NDEx Integrated Query (IQuery) 是一种用于基于网络和通路的基因集解释的新工具，可补充或扩展现有资源。它结合了新的途径来源、与 Cytoscape 的集成以及存储和共享分析结果的能力。 NDEx IQuery Web 应用程序根据存储在网络数据交换 (NDEx) 中的不同途径和网络执行多个基因集分析。
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